CovReport

Problem addressed

New Generation Sequencing revolutionized genome sequencing and is getting more and more available. However the comprehension of the generated reports is still a complicated task for non specialists. An important task is making NGS reports easy to interpret.

CovReport Figure 1

Figure 1 : Read coverage of genome sequencing

 

TECHNOLOGY

CovReport is a new gene sequencing coverage visualization tool that greatly facilitates the interpretation of diagnostic test sequencing reports. It generates a concise summary of the gene coverage allowing to evaluate the performance of the sequencing test at a glance.   CovReport Figure 2

Figure 2 : CovReport vizualisation sample

ADVANTAGES VS. STATE OF THE ART

  • Reliable scientific solution issued from a public research institution specializing in bioinformatics.
  • User friendly : easy to use tool, readable and understandable reports, suitable for clinicians without special genetics-related training.
  • In situ approval : the tool has been tested for a year in real hospital conditions and proved its efficiency (including several diagnosis changes).

APPLICATIONS

The visualization tool aims to broaden the scope of NGS users and facilitate coverage reading of NGS reports for clinicians in their everyday practice. Fiche PDF CovReport

Informations complémentaires

Axes Prioritaires

Santé & technologie du vivant

Sous-Axes

Dispositif médical & diagnostic

Propriété Intellectuelle

Dépôt de code APP

Statut de valorisation

Disponible pour licence et partenariat R&D

Propriétaire(s)

Aix-Marseille Université, Assistance Publique – Hôpitaux de Marseille, INSERM

Formulaire d’information pour :

CovReport

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